Helsingin kaupunkisuunnitteluun kuuluu oleellisesti myös erikoistuneet suunnitteluyksiköt, jotka tutkivat edellytyksiä suunnittelulle ja toteutukselle sekä suunnittelevat esimerkiksi kaupungin nimistöä ja rakennetun ympäristön suojelua.

Teknistaloudellinen toimisto tutkii mm. maaperää, ilmansaasteita, pohjaveden tasoja ja melumääriä.

Ympäristötoimistossa huolehditaan maisemasta, kulttuuriympäristöstä, luonnosta ja virkistysalueista.

Tutkimustoimistossa selvitetään kaupunkitilan erilaistumista sekä toiminnallisia ja sosiaalisia kysymyksiä, esimerkiksi eri toimintojen seudullisuutta ja kaupungin tulevaisuuden kehitysnäkymiä.

Kaupunki saa kaduilleen ja puistoilleen nimet asemakaavoissa. Nimistötoimikunta työskentelee yhteistyössä suunnittelijoiden kanssa.